La Junta de Coordinación es el órgano responsable de regir, administrar y representar a la Coordinadora Estatal de Ciencias Ambientales, estando compuesta por representantes de los diferentes Colegios y Asociaicones que constituyen la CECCAA. Su composición actual es:
- Presidente/a: Pablo Martínez (CoAmb-CV)
- Secretario/a: Paula Baldó (Acastur)
- Tesorero/a: Hernando Caldeiro (AGA)
- Presidente/a de entidad CECCAA: Juan García-Muñoz (COAMBM)
- Presidente/a de entidad CECCAA: Ricard Vizcarra (CoAmb-Cat)
- Presidente/a de entidad CECCAA: Manuel Barrera (COAMBA)
- Presidente/a de entidad CECCAA: Iván Galao (CoAmbRM)
- Representante de Sección de Posicionamiento y Participación: Sergio Velasco (ACACLM)
- Representante de Sección de Universidad: Eder Somoza (IZE-Euskadi)
- Representante de Observatorio de las Ciencias Ambientales: Mercè Morató (ALCAIB)